2020年6月21日，针对旗下北京工厂出现确诊病例一事，百事中国在官方微博发布声明表示，包括北京百事可乐饮料有限公司在内的、生产百事可乐等饮料产品的全国各百事各灌装厂迄今为止并未发现任何新冠肺炎确诊病例。北京新冠发布会通报发生疫情个案的工厂只是位于北京大兴区磁魏路1号的百事食品一个分厂，其从未生产任何饮料产品。

百事中国表示，百事饮料的灌装厂生产经营一直有序开展，未曾停产停业，百事全系列饮料产品符合国家各项标准，一直依法正常供应。

此次出现确诊病例的这家食品公司为百事公司旗下的大兴磁魏路分厂，为薯片等膨化食品、粮食加工品的生产厂。百事公司大中华区集团事务部企宣总监樊志敏在发布会上通报，公司出现确诊病例后，已第一时间启动应急预案，采取停产停工，产品封存、环境消杀、人员隔离等措施，已经对产品及常去环境进行了全方位取样调查。

另外，百事公司旗下北京百事可乐饮料有限公司的地址在大兴区，股权结构显示，北京百事可乐的控股股东为百事（中国）投资有限公司，占65%股份；北京一轻控股有限责任公司占35%股份，该公司也是北京北冰洋食品有限公司、北京义利食品有限公司的100%控股股东。6月21日，北京一轻食品集团公司发布澄清声明称，旗下义利或北冰洋工厂没有发生任何疫情，公司为全体员工进行核酸检测，检测结果100%为阴性。